Não, é um curso regular de EJA, ou seja, você precisa acompanhar as aulas, realizar as provas das Unidades e ter uma presença comprovada no curso para ter acesso ao seu certificado.
O Encceja é uma prova do Governo Federal que permite ao cidadão que atinge a nota mínima, receber o certificado do Ensino Básico. Portanto, os cursos preparatórios para o Encceja são livres, e as pessoas os realizam para tentar ir melhor na prova, como um curso pré-vestibular.
São dois formatos diferentes que te permitem concluir seus estudos.